Em 12 de setembro de 1992, foi fundada a Paróquia São João Batista. Esta foi desmembrada das Paróquias Santo Antônio de Pádua e Nossa senhora da Abadia, sendo fundada pelo Bispo Dom João Bosco Óliver de Faria. Em 1999, foi lançada a pedra fundamental para a construção da Igreja Matriz São João Batista, sendo presidida pelo Bispo Dom João Bosco Óliver de Faria.
Durante esse período os seguintes padres passaram por nossa paróquia:
Padre Vicente Ferreira de Lima (Pároco-1993),
Padre João Batista da Silva (Administrador Paroquial-1993),
Padre José Moreira de Melo (Vigário-1994),
Padre João Batista da Silva (Pároco-1994),
Padre Vanderci Ataíde Santana (Administrador Paroquial-1995),
Monsenhor José Magno do Nascimento (Pároco-1996),
Padre James Dean (Pároco-2002),
Padre Osvaldo Lopes de Camargos (Pároco-2004),
Padre Eudes José da Silva (Administrador Paroquial-2005),
Padre Fernando Antônio Coelho (Administrador Paroquial-2005 e Pároco-2007),
Padre Roberto Cristino de Oliveira (Administrador Paroquial-2012),
Padre Sizenando Roberto de Oliveira (Pároco-2012),
Padre Ezequiel Macedo Galvão (Pároco-2016),
Monsenhor Vanderly Francisco de Sousa (Vigário-2016 e Administrador Paroquial-2018),
Padre Lucas Espedito Machado (Pároco-2019),
Padre Marcelo Ribeiro de Andrade (Vigário-2019),
Padre Cleber Faria Silva (Vigário Paroquial – 2019).
No território da Paróquia São João Batista, está localizado o Seminário Maior Dom José André Coimbra e a Congregação das Irmãs Discípulas de Jesus Eucarístico – Casa das Meninas.
Fazem parte da Paróquia 10 comunidades, sendo 2 urbanas e 8 rurais. A Paróquia é composta por 9 bairros.